食用菌產業快速發展，在栽培過程中不可避免會產生大量廢棄菌棒，隨意丟棄不僅占用大面積土地，而且會影響生態環境。因此，對廢棄菌棒的安全處理和有效利用是食用菌產業發展中不容忽視的研究課題。
一、廢棄菌棒產生的原因
前期發菌過程中因雜菌感染約有5%左右的菌棒被廢棄，河北省易縣作為山區食用菌生產大縣，高峰期時生產的菌棒每年達1610萬棒，因雜菌感染被廢棄的菌棒達80萬棒以上，直接經濟損失160-170萬元，加上生產中的其他成本，總損失約200萬元左右。
每一個菌菇生產周期結束后，已經完成出菇的菌棒和營養基本耗盡的菌棒被廢棄，此類菌棒占廢棄菌棒的90%，每年大約1500萬棒。
二、廢棄菌棒的危害
1.浪費木材資源。以易縣食用菌高峰期生產的菌棒估算，每個生產周期因雜菌感染菌棒導致直接損失木屑原料約800噸，人力物力浪費。
2.廢棄菌棒占用大量土地。散亂在河灘谷地、田間地頭和山腳梯田、大棚邊緣等，占用了可觀的土地和耕地，特別是在山區土地稀缺的地方更加明顯，不但有礙觀瞻、妨礙出行，而且一定程度上影響了新農村建設進程。
3.污染生態環境。廢棄菌棒尤其在雨熱同季的夏天，雜菌滋生，導致菌菇生產區發病率和感染率大大增加并影響來年生產。同時，長期堆放的廢棄菌棒，腐爛后的菌渣滲液滋生蚊蟲、傳播疾病，污染水源和污染空氣，對人們生活環境造成危害。
三、對廢棄菌棒循環利用的探討
1.作為生產原料重復利用。對發菌過程中產生的廢棄菌棒，用物理方法將污染部分剔除、深埋，將未被污染部分進行破碎加工，通過二次發酵和高溫殺菌，混入原料木屑重新制作菌棒，每年可節省木材300噸左右，實現廢物利用。
2.作為有機肥使用。無論是廢菌棒還是廢菇棒，都還有一定的營養成分，一是利用廢棄菌棒中殘留的木質素、纖維素以及糖類制作成花肥和營養土，培育花卉綠植和蔬菜育苗基質，干凈清潔，費用低廉；二是對分解、破碎后的菌棒木屑按比例添加雞糞、豬糞等制成有機肥，施入農田，能夠有效地提高土壤吸納水肥能力，改善土壤板結狀況，一舉多得。
3.制作生物質燃料。將生產周期結束后的廢菌棒去掉薄膜后粉碎，加入輔料，按照主料輔料7：3的比例進行預混，用機器壓制成塊，經測算熱量可達3000-3200大卡/kg，可當做食用菌生產前期的高溫滅菌燃料二次利用，也可以補充環保煤的缺口，直接作為農村冬季取暖及生活的燃料使用，切實可行。
4.作為沼氣池發酵材料。將廢棄菌棒破碎，在干凈平整的場地晾曬，起堆高溫發酵、消毒后入沼氣池，可以有效解決農村建沼氣池原料不足問題，而且發酵后的沼渣也可以作為果蔬肥料還田，真正實現生物能源的循環利用。
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