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    廣東省微生物所是科研機構中的小塊頭，卻有大智慧、大業績。所主持的“食品微生物安全快速檢測與控制技術研究”獲得2010年國家科技進步獎二等獎（已通過公示），“食用菌優質高效大規模生產關鍵技術研究”項目獲得2007年國家科技進步獎二等獎，這是我國食用菌行業20年來首次獲得國家級獎勵。 
    該所建有華南地區最大、全國第二的大型真菌標本館，承擔中國乃至世界范圍的相關微生物類群的分類鑒定和物種多樣性的評估工作，館藏標本6萬多號，眾多標本在全國乃至世界上是獨一無二的，堪稱“國寶”。由該所主持的食品生物安全項目，成功解決了食品生物安全監測與控制的重大關鍵技術難題；由該所主持的環保科研項目獲國家環保科技進步獎一等獎，是全國唯一一家也是首家獲得該獎的省屬科研機構。 依托該所的“廣東省菌種保藏與應用重點實驗室”主要從事公益性應用基礎研究工作，在近10年評估中，連續4次獲得省優秀重點實驗室稱號，是依托省屬科研機構中唯一一家。依托廣東省微生物所的廣東省微生物菌種保藏中心，是華南地區最大、廣東省唯一的微生物種質資源庫，主要承擔微生物資源的分離、篩選、鑒定、保護以及前瞻性的功能挖掘應用基礎研究，是國家戰略資源保藏的重要基地。

    毒蘑菇是致死率較高的突發公共衛生事件之一，毒蘑菇研究為搶救生命贏得時間。華南地區是毒蘑菇中毒發生最頻繁的地區。李泰輝研究員帶領的團隊長期以來致力于對廣東省乃至華南地區毒蘑菇的調查研究、種類鑒別、毒性檢測以及毒蘑菇中毒預防宣傳的工作，為政府部門的食品安全預警、搶救中毒者提供科學依據，為廣東及華南地區的毒蘑菇識別、中毒預防和治療提供科學依據和實現資源信息共享服務。每年無償監測廣東省毒蘑菇發生情況，及時發布相關的預警信息，參與每年廣東省毒蘑菇中毒事件的救治咨詢和毒菌鑒定工作，為救治患者及社會穩定作出了重要貢獻。
 
    食用菌優質高效大規模生產關鍵技術“遍地開花”。該所的前身中科院真菌研究室就致力于真菌的研究、分類、開發工作。早在上世紀80年代初期，該所科研人員使得只能在自然環境下生長的短裙竹蓀在室內人工栽培成功，使得平時季度性很強的山珍野味走入尋常百姓的餐桌，該技術獲得1983年國家科技進步發明獎三等獎。
 
    針對食用菌資源利用不足、菌種管理混亂、產品附加值低、質量參差不齊等痼疾，該所以楊小兵研究員為首的食用菌研究團隊在食用菌產業的資源開發、制種、深加工和質量監控等主要環節展開了系統研究，同時對野生大型真菌開展了系統的分類鑒定、采集分離、純化保藏、良種選育和馴化栽培工作。創新研制了食用菌菌種中長期穩定保藏方法、主產品種遺傳指紋快速鑒定方法、食用菌產品質量快速檢測技術、新型食用菌深加工產品生產技術等擁有自主知識產權的系列關鍵技術和產品，為食用菌產業從傳統作坊式生產向現代農業的工廠化、產業化生產升級換代創造了條件。
 
    據了解，廣東省微生物所目前正與加拿大、坦桑尼亞等國專家共同研究利用食（藥）用菌的有效成分治療惡性腫瘤、艾滋病等對人類威脅極大的疾病，并已取得可喜的進展。
 
    另外，這個研究所在真菌分類的研究工作在全國屬于“一枝獨秀”，還使防霉抗菌新材料走進千家萬戶。這是一個集基礎研究與應用研究于一體、體量小但能做大文章的研究所。