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    發(fā)布時(shí)間：2021-11-12

      來源：中國(guó)科學(xué)報(bào)

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         近日，中國(guó)工程院院士、廣東省科學(xué)院微生物研究所名譽(yù)所長(zhǎng)吳清平團(tuán)隊(duì)完成了白肉靈芝的全基因組測(cè)序。據(jù)悉，這是世界上首次對(duì)白肉靈芝的基因組進(jìn)行組裝和注釋，相關(guān)研究發(fā)表于《G3：基因，基因組，遺傳學(xué)》。
         白肉靈芝是在中國(guó)發(fā)現(xiàn)的靈芝科一新種，具有多種藥理活性。作為我國(guó)具有鮮明地域特色的野生資源，白肉靈芝目前已成為科技扶貧和帶動(dòng)一方經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要資源，在中國(guó)西南地區(qū)廣泛種植。但由于缺乏參考基因組，其遺傳研究受到阻礙。
         研究人員從一個(gè)單核菌株中提取了高質(zhì)量的DNA，并基于Illumina和Nanopore平臺(tái)組裝完成第一個(gè)白肉靈芝全基因組。組裝的基因組大小為50.05Mb，N50為3.06Mb，預(yù)測(cè)到78206條編碼序列和13390個(gè)基因。
         此外，研究人員分析了白肉靈芝和靈芝之間次級(jí)代謝產(chǎn)物（萜類化合物）的功能基因的差異。研究發(fā)現(xiàn)，與靈芝相比，白肉靈芝具有更多與萜類化合物合成相關(guān)的基因，這可能是它們表現(xiàn)出不同生物活性的原因之一。
         據(jù)吳清平團(tuán)隊(duì)成員胡惠萍介紹，白肉靈芝基因組是目前組裝質(zhì)量最好的靈芝屬物種。該成果為今后特定物種的高原適應(yīng)性深層研究奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

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