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    福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)栽培靈芝“紫芝S2” 完成全基因組測(cè)序及分析

    發(fā)布時(shí)間：2021-12-04

      來(lái)源：中國(guó)食用菌商務(wù)網(wǎng)

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         近日，福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在《生物技術(shù)通報(bào)》在線發(fā)表研究論文。他們首次完成靈芝栽培品種“武芝2號(hào)”（通稱“紫芝S2”）的基因測(cè)序與組裝。
         據(jù)悉，“武芝2號(hào)”是目前國(guó)內(nèi)唯一實(shí)現(xiàn)商品化栽培的紫芝品種，于2005年從福建省野生紫芝種質(zhì)資源中選育獲得，2012年通過(guò)福建省非主要作物品種認(rèn)定。近年來(lái)，在福建、廣東及廣西等地推廣應(yīng)用形成年產(chǎn)量達(dá)3000噸以上的規(guī)模化栽培。
         該團(tuán)隊(duì)采用PacBio SMART技術(shù)并基于三代和二代數(shù)據(jù)，測(cè)序獲得序列總長(zhǎng)度56.849Mb的全基因組，包括：72條 Scaffolds，其中，71條Scaffolds構(gòu)成核基因組，另外1條為完整的線粒體基因組。
         其中，核基因組16681個(gè)基因，完成13161個(gè)基因的注釋，約占總數(shù)的78.89%，預(yù)測(cè)分析到4組串聯(lián)重復(fù)的rRNA基因簇、405個(gè)非編碼RNA和3305個(gè)啟動(dòng)子，并找到rpb2、beta-tubulin、terf-1α、CaM和Mn-SOD等基因序列以及漆酶同工酶基因，鯊烯合酶、羊毛甾醇合酶基因與麥角甾醇合成代謝相關(guān)基因、交配型基因座mat A&B及其分布位置，并發(fā)現(xiàn)一種新的真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白fip編碼基因。
         這為今后紫芝栽培品種（系）分子鑒定與菌株鑒別、功能基因的挖掘與利用提供可靠信息，同時(shí)，也為其后續(xù)開展中國(guó)栽培靈芝種類的比較基因組學(xué)分析積累科學(xué)數(shù)據(jù)。
         該基因組計(jì)劃始于2018年，依托特色食用菌繁育與栽培國(guó)家地方（福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院）聯(lián)合工程研究中心、福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院藥用植物研究中心、福建農(nóng)林大學(xué)和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所的科研平臺(tái)完成。

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