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福建省農業科學院食用菌研究所創新團隊栽培靈芝“紫芝S2” 完成全基因組測序及分析

發布時間：2021-12-04

來源：中國食用菌商務網

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近日，福建省農業科學院食用菌研究所創新團隊在《生物技術通報》在線發表研究論文。他們首次完成靈芝栽培品種“武芝2號”（通稱“紫芝S2”）的基因測序與組裝。
據悉，“武芝2號”是目前國內唯一實現商品化栽培的紫芝品種，于2005年從福建省野生紫芝種質資源中選育獲得，2012年通過福建省非主要作物品種認定。近年來，在福建、廣東及廣西等地推廣應用形成年產量達3000噸以上的規模化栽培。
該團隊采用PacBio SMART技術并基于三代和二代數據，測序獲得序列總長度56.849Mb的全基因組，包括：72條 Scaffolds，其中，71條Scaffolds構成核基因組，另外1條為完整的線粒體基因組。
其中，核基因組16681個基因，完成13161個基因的注釋，約占總數的78.89%，預測分析到4組串聯重復的rRNA基因簇、405個非編碼RNA和3305個啟動子，并找到rpb2、beta-tubulin、terf-1α、CaM和Mn-SOD等基因序列以及漆酶同工酶基因，鯊烯合酶、羊毛甾醇合酶基因與麥角甾醇合成代謝相關基因、交配型基因座mat A&B及其分布位置，并發現一種新的真菌免疫調節蛋白fip編碼基因。
這為今后紫芝栽培品種（系）分子鑒定與菌株鑒別、功能基因的挖掘與利用提供可靠信息，同時，也為其后續開展中國栽培靈芝種類的比較基因組學分析積累科學數據。
該基因組計劃始于2018年，依托特色食用菌繁育與栽培國家地方（福建省農業科學院）聯合工程研究中心、福建省農業科學院藥用植物研究中心、福建農林大學和中國醫學科學院藥用植物研究所的科研平臺完成。